Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPCAP84074 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HPCAP84074 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HPCAP84074 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HPCAP84074 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HPCAP84074 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HPCAP84074 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HPCAP84074 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HPCAP84074 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HPCAP84074 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HPCAP84074 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HPCAP84074 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HPCAP84074 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HPCAP84074 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HPCAP84074 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HPCAP84074 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPCAP84074 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms