Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF6P62330 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARF6P62330 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARF6P62330 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARF6P62330 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms