Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms