Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTPDP35247 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms