Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5A1P25705 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms