Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms