Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms