Protein–RNA interactions for Protein: P01782

IGHV3-9, Immunoglobulin heavy variable 3-9, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-9P01782 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-9P01782 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms