Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRAMEF2O60811 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRAMEF2O60811 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRAMEF2O60811 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRAMEF2O60811 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRAMEF2O60811 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRAMEF2O60811 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms