Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms