Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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