Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
A4D1N5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
A4D1N5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
A4D1N5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
A4D1N5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
A4D1N5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
A4D1N5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
A4D1N5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
A4D1N5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
A4D1N5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
A4D1N5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
A4D1N5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
A4D1N5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
A4D1N5 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
A4D1N5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
A4D1N5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
A4D1N5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
A4D1N5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
A4D1N5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
A4D1N5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
A4D1N5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
A4D1N5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
A4D1N5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
A4D1N5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
A4D1N5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms