Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2D4Q9Y2X8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms