Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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