Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms