Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms