Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRACR2AQ9BSW2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRACR2AQ9BSW2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRACR2AQ9BSW2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRACR2AQ9BSW2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms