Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCTD12Q96CX2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCTD12Q96CX2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCTD12Q96CX2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCTD12Q96CX2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCTD12Q96CX2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCTD12Q96CX2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCTD12Q96CX2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCTD12Q96CX2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCTD12Q96CX2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCTD12Q96CX2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCTD12Q96CX2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCTD12Q96CX2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCTD12Q96CX2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCTD12Q96CX2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCTD12Q96CX2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCTD12Q96CX2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCTD12Q96CX2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCTD12Q96CX2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCTD12Q96CX2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCTD12Q96CX2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCTD12Q96CX2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCTD12Q96CX2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCTD12Q96CX2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms