Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms