Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms