Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms