Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms