Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6P435 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6P435 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6P435 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms