Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFCAB12Q6NXP0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms