Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEXMIFQ5QGS0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEXMIFQ5QGS0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEXMIFQ5QGS0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEXMIFQ5QGS0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEXMIFQ5QGS0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEXMIFQ5QGS0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms