Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms