Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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PTPRNQ16849 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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PTPRNQ16849 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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PTPRNQ16849 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRNQ16849 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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