Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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