Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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