Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms