Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMB3Q13751 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms