Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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