Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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