Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMAN2Q12907 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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