Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFRD2Q12894 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFRD2Q12894 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms