Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOX4Q06945 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOX4Q06945 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOX4Q06945 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOX4Q06945 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOX4Q06945 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOX4Q06945 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SOX4Q06945 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOX4Q06945 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOX4Q06945 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOX4Q06945 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOX4Q06945 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOX4Q06945 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOX4Q06945 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms