Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARDQ03181 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms