Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms