Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOSBP53539 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOSBP53539 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms