Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms