Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPZBP47756 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms