Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA5P28066 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA5P28066 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms