Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DSPP15924 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSPP15924 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSPP15924 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSPP15924 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSPP15924 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSPP15924 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSPP15924 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSPP15924 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSPP15924 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSPP15924 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms