Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-HP01893 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms