Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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