Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG4BQ9Y4P1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG4BQ9Y4P1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms