Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms