Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD12Q8N8I0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms