Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF648Q5T619 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms