Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDO1Q16878 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms